Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms