Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB2P26583 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms