Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms