Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms