Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms