Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIG1P18858 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms