Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms