Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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