Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EGR1P18146 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
EGR1P18146 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms