Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms