Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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