Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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