Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms