Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP104O60308 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP104O60308 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP104O60308 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms