Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms