Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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