Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF1O43189 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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