Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FABP7O15540 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FABP7O15540 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FABP7O15540 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FABP7O15540 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FABP7O15540 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FABP7O15540 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FABP7O15540 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FABP7O15540 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FABP7O15540 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FABP7O15540 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FABP7O15540 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FABP7O15540 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FABP7O15540 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FABP7O15540 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms