Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms