Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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USP9YO00507 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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