Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms