Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CFAP73A6NFT4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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CFAP73A6NFT4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CFAP73A6NFT4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CFAP73A6NFT4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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