Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SNX13Q9Y5W8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SNX13Q9Y5W8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SNX13Q9Y5W8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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SNX13Q9Y5W8 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SNX13Q9Y5W8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SNX13Q9Y5W8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SNX13Q9Y5W8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SNX13Q9Y5W8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SNX13Q9Y5W8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SNX13Q9Y5W8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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