Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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