Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms