Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SHANK2Q9UPX8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms