Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms