Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms