Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MARCH4Q9P2E8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms