Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms