Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88CQ9P219 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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