Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC180Q9P1Z9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC180Q9P1Z9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms