Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms