Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms