Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms