Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO5CQ9NQX4 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms