Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms