Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms