Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms