Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms