Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms