Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms