Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms