Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms