Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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