Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP3Q96P20 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP3Q96P20 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms