Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
STAMBPL1Q96FJ0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STAMBPL1Q96FJ0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms