Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms