Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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