Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TAF4BQ92750 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF4BQ92750 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms